경북대학교 차세대시퀀싱 핵심연구지원센터

경북대학교 차세대시퀀싱 핵심연구지원센터는 기초과학지원연구원의 지원을 받아
효율적인 차세대 염기서열 분석 및 기본 빅데이터 분석을 제공합니다.

우리 센터는 DNA 추출, sequencing library 제작, NGS 장비 구동, 및 기초 데이터 분석(일부 서비스에 한함)을 지원해
드리며 이를 위한 기본 장비, 2세대 및 3세대 NGS 장비, 및 빅데이터 분석 서버 등을 보유하고 있습니다.

A Major Service

16S rRNA gene/ITS region amplicon sequencing

세균의 16S rRNA gene, 진균의 ITS region을 기반으로, 미생물 군집(마이크로바이옴)을 분석하기 위한 amplicon sequencing

Whole metagenome sequencing

특정 시료 내 모든 미생물 군집 확인을 위해 시료 내 모든 미생물의 유전체를 분석하기 위한 whole metagenome sequencing

whole genome sequencing

미생물 전장 유전체 해독(유전체 조립, 유전체 주석화)을 위해 미생물 유전체를 분석하는 whole genome sequencing

RNA
sequencing

특정 미생물 혹은 환경 내 발현 차이를 확인하기 위해 단일 미생물 혹은 시료 내 모든 미생물의 RNA를 분석하기 위한 RNA sequencing

Major equipments

Illimina MiSeq system

NGS platform for amplicon sequencing

Illumina MiSeq system은 차세대시퀀싱 핵심연구지원센터 내 16S rRNA gene / ITS region 영역을 대상으로 한 amplicon sequencing에 활용되고 있습니다. 상기 장비 사용을 위해서는 "16S rRNA gene amplicon sequencing" 및 "ITS region amplicon sequencing" 서비스를 예약해 주시면 감사하겠습니다.

MGI DNBSEQ G400-RS system

NGS platform for whole metagenome/RNA sequencing

MGI DNBSEQ G400-RS system은 차세대시퀀싱 핵심연구지원센터 내 whole metagenome / RNA sequencing에 활용되고 있습니다. 상기 장비 사용을 위해서는 "whole metagenome sequencing" 및 "RNA sequencing" 서비스를 예약해 주시면 감사하겠습니다.

Oxford Nanopore MinION system

NGS platform for whole genome sequencing

Oxford Nanopore MinION system은 차세대시퀀싱 핵심연구지원센터 내 whole genome sequencing에 활용되고 있습니다. 상기 장비 사용을 위해서는 "whole metagenome sequencing" 및 "RNA sequencing" 서비스를 예약해 주시면 감사하겠습니다.